fr.ifremer.allegro.data.sample
Class Sample

java.lang.Object
  fr.ifremer.allegro.data.sample.Sample

All Implemented Interfaces:

java.io.Serializable

Direct Known Subclasses:

SampleImpl

public abstract class Sample
extends java.lang.Object
implements java.io.Serializable

Un pr??l??vement repr??sente un (et un seul) support, pr??lev?? au cours d'une op??ration de peche, d'un ??chantillonnage au d??barquement ou d'une vente. Il s'agit de la partie qui est recueillie pour analyse ou d??nombrement.

Un pr??l??vement est rattach?? ?? une op??ration de peche ou un groupe d'op??rations, un d??barquement ou ?? une vente. Il peut ??tre en plus rattach?? ?? un des lots ??chantillonn??s (le lot de provenance).

Dans le cas des mar??es observ??es en mer, un prl??vement correspond ?? un individu, dont le support est, par exemple :

- crustac?? (crevette...)

- poisson (merlu, sardine...)

- gast??ropode (bigorneau, littorine...)

- echinoderme (oursin...)

- etc.

Le nombre d'individu, g??n??ralement ??gal ?? 1, permet de constituer des pr??l??vement de plusieurs individu (d??s lors qu'il sont ne meme anture). Chaque r??sultat de mesure (SampleMeasurement) pourra identifi?? l'individu concern?? par la mesure, par une num??ro din'dividu.

Un mn??monique, repr??sentant g??n??ralement l'??tiquette coll??e sur le sachet contenant le pr??l??vement, permet d"identifier le pr??l??vement de mani??re simple, notamment en laboratoire pour la saisie des lectures d'age, etc..

Par exemple de pr??l??vement :

- un poisson, d'une esp??ce donn??e, sur lequel est pr??lev?? un otholithe, et/ou des ??cailes afin de r??aliser une lecture d'age.

- un c??tac??, issu d'un lot, sur lesquels doit ??tre effectu?? des analyses d'age, de taille,

- etc.

See Also:

Serialized Form

Nested Class Summary

static class

Sample.Factory Constructs new instances of Sample.

Constructor Summary

Sample()

Method Summary

boolean	equals(java.lang.Object object) This entity does not have any identifiers and is not extending any other entity, so this method will only return true if the argument reference and this refer to the same object.
Batch	getBatch() Lot auquel appartient l'??chantillon analys?? (optionnel).
java.util.Collection	getChildSamples()
java.lang.String	getComments() Commentaire libre concernant l'??chantillon.
java.util.Date	getControlDate()
java.util.Date	getCreationDate()
java.util.Collection	getFishingAreas() Zone de peche du pr??l??vement (utilis?? surtout dans le cas d'un pr??l??vement hors mar??e/d??barquement ou vente - exemple : pr??l??vement en poissonnerie)
FishingOperation	getFishingOperation() Op??ration de pr??l??vement ?? laquelle est rattach?? l'??chantillon analys??.
java.lang.Integer	getId() Identifiant de l'??chantillon.
java.lang.Short	getIndividualCount() Nombre d'individus constituant l'??chantillon.
java.lang.String	getLabel() Mn??monique du pr??l??vement.
Matrix	getMatrix() Support de l'??chantillon.
Sample	getParentSample() Parent sample.
Program	getProgram()
java.lang.String	getQualificationComments()
java.util.Date	getQualificationDate()
QualityFlag	getQualityFlag() Niveau de qualit?? de la donn??e.
Department	getRecorderDepartment()
User	getRecorderUser()
ReferenceTaxon	getReferenceTaxon() Taxon (esp??ce scientifique) caract??ristant l'??chantillon (optionnel)
java.util.Date	getSampleDate() Jour du pr??l??vement (heure optionnelle).
java.util.Collection	getSampleMeasurements()
java.lang.Float	getSize() La taille de l'??chantillon peut repr??senter une surface ou un volume suivant les cas.
Unit	getSizeUnit() Unit?? associ??e ?? la valeur de la taille du pr??l??vement.
TaxonGroup	getTaxonGroup() Groupe de taxon (g??n??ralement esp??ce commerciale) caract??ristant l'??chantillon (optionnel)
java.sql.Timestamp	getUpdateDate()
java.util.Date	getValidationDate()
int	hashCode() Returns a hash code based on this entity's identifiers.
void	setBatch(Batch batch)
void	setChildSamples(java.util.Collection childSamples)
void	setComments(java.lang.String comments)
void	setControlDate(java.util.Date controlDate)
void	setCreationDate(java.util.Date creationDate)
void	setFishingAreas(java.util.Collection fishingAreas)
void	setFishingOperation(FishingOperation fishingOperation)
void	setId(java.lang.Integer id)
void	setIndividualCount(java.lang.Short individualCount)
void	setLabel(java.lang.String label)
void	setMatrix(Matrix matrix)
void	setParentSample(Sample parentSample)
void	setProgram(Program program)
void	setQualificationComments(java.lang.String qualificationComments)
void	setQualificationDate(java.util.Date qualificationDate)
void	setQualityFlag(QualityFlag qualityFlag)
void	setRecorderDepartment(Department recorderDepartment)
void	setRecorderUser(User recorderUser)
void	setReferenceTaxon(ReferenceTaxon referenceTaxon)
void	setSampleDate(java.util.Date sampleDate)
void	setSampleMeasurements(java.util.Collection sampleMeasurements)
void	setSize(java.lang.Float size)
void	setSizeUnit(Unit sizeUnit)
void	setTaxonGroup(TaxonGroup taxonGroup)
void	setUpdateDate(java.sql.Timestamp updateDate)
void	setValidationDate(java.util.Date validationDate)

Methods inherited from class java.lang.Object

clone, finalize, getClass, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Constructor Detail

Sample

public Sample()

Method Detail

getId

public java.lang.Integer getId()

Identifiant de l'??chantillon.

setId

public void setId(java.lang.Integer id)

getLabel

public java.lang.String getLabel()

Mn??monique du pr??l??vement. Par exemple, il peut s'agir d'un code propre ?? chaque programme : pour les mar??es observ??e, par exemple, il s'agira d'une ??tiquette permettant d'identifier l'??chantillon sur le terrain puis en laboratoire.

Autant que possible, le mn??monique devra etre unique pour tous le syst??me, ou ?? d??faut unique au sein de la mar??e, du d??barquement, de la vente ou de la campagne.

Nomenclature retenue ?? l'issu des sp??cifications Allegro V3 : ____

Avec :

- : date de l???observation au format AAAMMJJ. La date est issue (suivant la donn??e m??re rattach??e) :

* de la date de d??but de l???op??ration de p??che ou du groupe d???op??rations (si p??riode du groupe d???op??ration n???a pas ??t?? renseign?? : prendre la date de d??but de la mar??e)

* ou de la date de d??barquement,

* ou de la date de la vente.

- : il s???agit des initiales d??j?? saisit par l???utilisateur (cf variante pr??c??dente).

- : mn??monique du lieu d???observation, si pr??sent, ou libell?? sinon. Le lieu d???observation est issu (suivant la donn??e m??re rattach??e) :

* pour une op??ration de p??che ou un groupe d???op??rations, il s???agit du port de d??part de la mar??e,

* pour un d??barquement, du lieu de d??barquement

* pour une vente, du lieu de la vente

- : suivant la donn??e m??re rattach??e :

* ???G??? (=Ground) si donn??e m??re rattach??e est un d??barquement ou une vente ;

* ???S??? (=Sea) si donn??e m??re rattach??e est une op??ration de p??che ou ?? une groupe d???op??rations.

- : Il s???agit d???un num??ro au format NNN (sur trois caract??re. Exemple : ?? 001 ??), auto-incr??ment??e (valeur maximale connue + 1) de mani??re ?? ??tre unique au sein de (suivant la donn??e m??re rattach??e) :

* la mar??e, si la donn??e m??re rattach??e est une op??ration de p??che ou un groupe d???op??rations

* ou du d??barquement,

* ou de la vente

setLabel

public void setLabel(java.lang.String label)

getSampleDate

public java.util.Date getSampleDate()

Jour du pr??l??vement (heure optionnelle).

setSampleDate

public void setSampleDate(java.util.Date sampleDate)

getIndividualCount

public java.lang.Short getIndividualCount()

Nombre d'individus constituant l'??chantillon.

setIndividualCount

public void setIndividualCount(java.lang.Short individualCount)

getSize

public java.lang.Float getSize()

La taille de l'??chantillon peut repr??senter une surface ou un volume suivant les cas. Il peut aussi s'agir du nombre d'individus entrant dans l'homog??nat.

setSize

public void setSize(java.lang.Float size)

getComments

public java.lang.String getComments()

Commentaire libre concernant l'??chantillon.

setComments

public void setComments(java.lang.String comments)

getCreationDate

public java.util.Date getCreationDate()

setCreationDate

public void setCreationDate(java.util.Date creationDate)

getControlDate

public java.util.Date getControlDate()

setControlDate

public void setControlDate(java.util.Date controlDate)

getValidationDate

public java.util.Date getValidationDate()

setValidationDate

public void setValidationDate(java.util.Date validationDate)

getQualificationDate

public java.util.Date getQualificationDate()

setQualificationDate

public void setQualificationDate(java.util.Date qualificationDate)

getQualificationComments

public java.lang.String getQualificationComments()

setQualificationComments

public void setQualificationComments(java.lang.String qualificationComments)

getUpdateDate

public java.sql.Timestamp getUpdateDate()

setUpdateDate

public void setUpdateDate(java.sql.Timestamp updateDate)

getSampleMeasurements

public java.util.Collection getSampleMeasurements()

setSampleMeasurements

public void setSampleMeasurements(java.util.Collection sampleMeasurements)

getParentSample

public Sample getParentSample()

Parent sample. Use in MerluMed.

Ex : un poisson peut avoir dans sont estomac plusieurs autres poissons.

setParentSample

public void setParentSample(Sample parentSample)

getChildSamples

public java.util.Collection getChildSamples()

setChildSamples

public void setChildSamples(java.util.Collection childSamples)

getMatrix

public Matrix getMatrix()

Support de l'??chantillon.

setMatrix

public void setMatrix(Matrix matrix)

getSizeUnit

public Unit getSizeUnit()

Unit?? associ??e ?? la valeur de la taille du pr??l??vement.

setSizeUnit

public void setSizeUnit(Unit sizeUnit)

getBatch

public Batch getBatch()

Lot auquel appartient l'??chantillon analys?? (optionnel).

setBatch

public void setBatch(Batch batch)

getTaxonGroup

public TaxonGroup getTaxonGroup()

Groupe de taxon (g??n??ralement esp??ce commerciale) caract??ristant l'??chantillon (optionnel)

setTaxonGroup

public void setTaxonGroup(TaxonGroup taxonGroup)

getReferenceTaxon

public ReferenceTaxon getReferenceTaxon()

Taxon (esp??ce scientifique) caract??ristant l'??chantillon (optionnel)

setReferenceTaxon

public void setReferenceTaxon(ReferenceTaxon referenceTaxon)

getRecorderUser

public User getRecorderUser()

setRecorderUser

public void setRecorderUser(User recorderUser)

getProgram

public Program getProgram()

setProgram

public void setProgram(Program program)

getRecorderDepartment

public Department getRecorderDepartment()

setRecorderDepartment

public void setRecorderDepartment(Department recorderDepartment)

getQualityFlag

public QualityFlag getQualityFlag()

Niveau de qualit?? de la donn??e.

"Non qualifi??e" par d??faut

setQualityFlag

public void setQualityFlag(QualityFlag qualityFlag)

getFishingOperation

public FishingOperation getFishingOperation()

Op??ration de pr??l??vement ?? laquelle est rattach?? l'??chantillon analys??.

setFishingOperation

public void setFishingOperation(FishingOperation fishingOperation)

getFishingAreas

public java.util.Collection getFishingAreas()

Zone de peche du pr??l??vement (utilis?? surtout dans le cas d'un pr??l??vement hors mar??e/d??barquement ou vente - exemple : pr??l??vement en poissonnerie)

setFishingAreas

public void setFishingAreas(java.util.Collection fishingAreas)

equals

public boolean equals(java.lang.Object object)

This entity does not have any identifiers and is not extending any other entity, so this method will only return true if the argument reference and this refer to the same object.

Overrides:

equals in class java.lang.Object

hashCode

public int hashCode()

Returns a hash code based on this entity's identifiers.

Overrides:

hashCode in class java.lang.Object