fr.ifremer.adagio.core.dao.referential.taxon

Class TaxonomicLevel

Object

TaxonomicLevel

All Implemented Interfaces:

Serializable, Comparable<TaxonomicLevel>

Direct Known Subclasses:

TaxonomicLevelImpl

public abstract class TaxonomicLevel
extends Object
implements Serializable, Comparable<TaxonomicLevel>

Liste des rangs taxinomiques possibles. C’est le nom du rang dans la classification systématique ; les niveaux systématiques sont désignés par des termes consacrés (ex. : espèce, genre, famille, etc.). Le niveau systématique d’un taxon peut changer avec l’évolution de la classification ; dans ce cas, son libellé est susceptible de changer également car les suffixes notamment obéissent à des règles strictes de nomenclature (règle [R0018]). Les niveaux systématiques pris en compte dans le référentiel taxinomique Quadrige² sont (par ordre de rang) (le nom anglais de chaque niveau est indiqué entre parenthèses) : - Règne (kingdom) - Sous-règne (subkingdom) - Division (division) / Embranchement (phylum) - Subdivision (subdivision) / Sous-embranchement (subphylum) - Super-classe (superclass) - Classe (class) - Sous-classe (subclass) - Infra-classe (infraclass) - Super-ordre (superordo) - Ordre (ordo) - Sous-ordre (subordo) - Infra-ordre (infraordo) - Section (section) - Sous-section (subsection) - Super-famille (superfamily) - Famille (family) - Sous-famille (subfamily) - Tribu (tribe) - Sous-tribu (subtribe) - Genre (genus) - Sous-genre (subgenus) - Espèce (species) - Sous-espèce (subspecies) - Variété (variety) - Sous-variété (subvariety) - Forme (forma) - Sous-forme (subforma) - Incertae sedis (dummy = taxons inclassables)

See Also:

Serialized Form

Nested Class Summary

Nested Classes

Modifier and Type	Class and Description
static class	TaxonomicLevel.Factory Constructs new instances of TaxonomicLevel.

Constructor Summary

Constructors

Constructor and Description
TaxonomicLevel()

Method Summary

Methods

Modifier and Type	Method and Description
boolean	addTaxonNames(TaxonName elementToAdd) Classe regroupant les taxons.
int	compareTo(TaxonomicLevel o)
boolean	equals(Object object) Returns true if the argument is an TaxonomicLevel instance and all identifiers for this entity equal the identifiers of the argument entity.
String	getCode() Code unique identifiant le rang taxinomique.
String	getComments() Commentaire décrivant le rang taxinomique
Date	getCreationDate() Date de création système du niveau.
String	getLabel() Mnémonique du rang taxinomique
String	getName() Libellé du rang taxinomique
Integer	getRank() Numéro du rang taxinomique.
Status	getStatus() Pour les données du référentiel, information permettant de déterminer si une donnée est valide, obsolète ou temporaire
Collection<TaxonName>	getTaxonNames() Classe regroupant les taxons.
Timestamp	getUpdateDate() Date de mise à jour système du niveau.
int	hashCode() Returns a hash code based on this entity's identifiers.
boolean	removeTaxonNames(TaxonName elementToRemove) Classe regroupant les taxons.
void	setCode(String codeIn) Code unique identifiant le rang taxinomique.
void	setComments(String commentsIn) Commentaire décrivant le rang taxinomique
void	setCreationDate(Date creationDateIn) Date de création système du niveau.
void	setLabel(String labelIn) Mnémonique du rang taxinomique
void	setName(String nameIn) Libellé du rang taxinomique
void	setRank(Integer rankIn) Numéro du rang taxinomique.
void	setStatus(Status statusIn) Pour les données du référentiel, information permettant de déterminer si une donnée est valide, obsolète ou temporaire
void	setTaxonNames(Collection<TaxonName> taxonNamesIn) Classe regroupant les taxons.
void	setUpdateDate(Timestamp updateDateIn) Date de mise à jour système du niveau.

Methods inherited from class Object

clone, finalize, getClass, notify, notifyAll, toString, wait, wait, wait

Constructor Detail

TaxonomicLevel

public TaxonomicLevel()

Method Detail

getCode

public String getCode()

Code unique identifiant le rang taxinomique.

Returns:

this.code String

setCode

public void setCode(String codeIn)

Code unique identifiant le rang taxinomique.

Parameters:

codeIn - String

getRank

public Integer getRank()

Numéro du rang taxinomique. Croissant du règne vers l'espèce Ceci permet de limiter le choix des niveaux fils aux numéros supérieurs

Returns:

this.rank Integer

setRank

public void setRank(Integer rankIn)

Numéro du rang taxinomique. Croissant du règne vers l'espèce Ceci permet de limiter le choix des niveaux fils aux numéros supérieurs

Parameters:

rankIn - Integer

getName

public String getName()

Libellé du rang taxinomique

Returns:

this.name String

setName

public void setName(String nameIn)

Libellé du rang taxinomique

Parameters:

nameIn - String

getLabel

public String getLabel()

Mnémonique du rang taxinomique

Returns:

this.label String

setLabel

public void setLabel(String labelIn)

Mnémonique du rang taxinomique

Parameters:

labelIn - String

getComments

public String getComments()

Commentaire décrivant le rang taxinomique

Returns:

this.comments String

setComments

public void setComments(String commentsIn)

Commentaire décrivant le rang taxinomique

Parameters:

commentsIn - String

getCreationDate

public Date getCreationDate()

Date de création système du niveau. Renseigné automatiquement par le système.

Returns:

this.creationDate Date

setCreationDate

public void setCreationDate(Date creationDateIn)

Date de création système du niveau. Renseigné automatiquement par le système.

Parameters:

creationDateIn - Date

getUpdateDate

public Timestamp getUpdateDate()

Date de mise à jour système du niveau. Renseigné automatiquement par le système.

Returns:

this.updateDate Timestamp

setUpdateDate

public void setUpdateDate(Timestamp updateDateIn)

Date de mise à jour système du niveau. Renseigné automatiquement par le système.

Parameters:

updateDateIn - Timestamp

getTaxonNames

public Collection<TaxonName> getTaxonNames()

Classe regroupant les taxons. Il s'agit en fait d'une combinaison entre un rang taxinomique, un nom de taxon, un code et éventuellement un auteur et une date. Cette classe regroupe les taxons valides, provisoires, obsolètes, virtuels et les synonymes. On garde l'historique du passage en taxon valide, puis du passage en synonyme (date de fin référent). Dans COST : "Use the FAO reference list ftp://ftp.fao.org/FI/stat/data/ASFIS_sp.zip"

Returns:

this.taxonNames Collection

setTaxonNames

public void setTaxonNames(Collection<TaxonName> taxonNamesIn)

Classe regroupant les taxons. Il s'agit en fait d'une combinaison entre un rang taxinomique, un nom de taxon, un code et éventuellement un auteur et une date. Cette classe regroupe les taxons valides, provisoires, obsolètes, virtuels et les synonymes. On garde l'historique du passage en taxon valide, puis du passage en synonyme (date de fin référent). Dans COST : "Use the FAO reference list ftp://ftp.fao.org/FI/stat/data/ASFIS_sp.zip"

Parameters:

taxonNamesIn - Collection

addTaxonNames

public boolean addTaxonNames(TaxonName elementToAdd)

Classe regroupant les taxons. Il s'agit en fait d'une combinaison entre un rang taxinomique, un nom de taxon, un code et éventuellement un auteur et une date. Cette classe regroupe les taxons valides, provisoires, obsolètes, virtuels et les synonymes. On garde l'historique du passage en taxon valide, puis du passage en synonyme (date de fin référent). Dans COST : "Use the FAO reference list ftp://ftp.fao.org/FI/stat/data/ASFIS_sp.zip"

Parameters:

elementToAdd - TaxonName

Returns:

true if this collection changed as a result of the call

removeTaxonNames

public boolean removeTaxonNames(TaxonName elementToRemove)

Classe regroupant les taxons. Il s'agit en fait d'une combinaison entre un rang taxinomique, un nom de taxon, un code et éventuellement un auteur et une date. Cette classe regroupe les taxons valides, provisoires, obsolètes, virtuels et les synonymes. On garde l'historique du passage en taxon valide, puis du passage en synonyme (date de fin référent). Dans COST : "Use the FAO reference list ftp://ftp.fao.org/FI/stat/data/ASFIS_sp.zip"

Parameters:

elementToRemove - TaxonName

Returns:

true if this collection changed as a result of the call

getStatus

public Status getStatus()

Pour les données du référentiel, information permettant de déterminer si une donnée est valide, obsolète ou temporaire. - obsolète (=inactif) : '0' - valide (=actif) : '1' - temporaire : '2' - en cours de suppression : '3' - : '4' note : on a préfère ici 'valide' au terme 'actif' (utilisé dans Harmonie), pour ne pas confondre avec par exemple l'activité d'un navire sur un mois.

Returns:

this.status Status

setStatus

public void setStatus(Status statusIn)

Pour les données du référentiel, information permettant de déterminer si une donnée est valide, obsolète ou temporaire. - obsolète (=inactif) : '0' - valide (=actif) : '1' - temporaire : '2' - en cours de suppression : '3' - : '4' note : on a préfère ici 'valide' au terme 'actif' (utilisé dans Harmonie), pour ne pas confondre avec par exemple l'activité d'un navire sur un mois.

Parameters:

statusIn - Status

equals

public boolean equals(Object object)

Returns true if the argument is an TaxonomicLevel instance and all identifiers for this entity equal the identifiers of the argument entity. Returns false otherwise.

Overrides:

equals in class Object

hashCode

public int hashCode()

Returns a hash code based on this entity's identifiers.

Overrides:

hashCode in class Object

compareTo

public int compareTo(TaxonomicLevel o)

Specified by:

compareTo in interface Comparable<TaxonomicLevel>

See Also:

Comparable.compareTo(T)